L’établissement est organisé en trois pôles sectoriels de psychiatrie générale (69 G25, 69 G26 et 69 G27) et deux pôles sectoriels de psychiatrie infanto-juvénile (69 I11 et 69 I12).
Sur ces secteurs, il met à la disposition de la population des services et des moyens de prévention, de diagnostic, de soin, de réadaptation et de réinsertion sociale. Ces services sont implantés à l’intérieur de l’hôpital, mais également sur l’ensemble du territoire couvert par les pôles sectoriels.
L’établissement dispose ainsi de multiples structures ambulatoires au plus près des populations :
- 11 centres médico-psychologiques (CMP) de psychiatrie générale
- 19 centres médico-psychologiques (CMP) de psychiatrie infanto-juvénile
- 9 centres d’action thérapeutique à temps partiel (CATTP) de psychiatrie générale
- 9 centres d’action thérapeutique à temps partiel (CATTP) de psychiatrie infanto-juvénile
- 7 hôpitaux de jour de psychiatrie générale
- 5 hôpitaux de jour de psychiatrie infanto-juvénile.
Au-delà de l’organisation en secteurs, l’établissement assure des prises en charge spécialisées pour la population des secteurs :
- Pôle accueil admission – comprenant une unité d’hospitalisation de courte durée (UHCD), et l’unité de psychiatrie d’urgence et de liaison (UPUL) implantée au sein du Centre hospitalier Saint-Joseph Saint-Luc
- Dispositif de prise en charge des troubles envahissants du développement Neurodev’
- Centre de soins intensifs ambulatoires et équipe mobile pour adolescents (CEMADO)
- Service d’hospitalisation pour adolescents du Rhône « Ulysse »
- Pôle de psychiatrie de la personne âgée
- Pôle de réhabilitation psychosociale
- Le centre régional d’évaluation et de traitement de la douleur en psychiatrie
- L’institut régional d’interventions systémiques (IRIS)
Le Centre hospitalier comprend également des services médicaux communs à l’ensemble des pôles sectoriels :
- Pôle de médecine polyvalente (PMP)
- Pharmacie.
